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あと docker や podman みたいなの使ってたら、そういうののコンテナ類のデータが入ってるようなディレクトリも除外するといい。
たとえば私の場合 podman 使ってるので

PRUNEPATHS="... /home/lo48576/.local/share/containers/storage"

みたいな感じの指定を加えている