基本的に暗号学的に安全な一方向のハッシュ関数で保存するんですけど、ただ保存するとあとでより強力なアルゴリズムとかに変わったときに対応できなくなるのでアルゴリズムといくつかのシードをハッシュに付けて保存して「生のパスワードのとその合成されたハッシュ」でもって比較するのが現在の主流なんじゃないかな
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