はっきり言ってしまいますが、 markdown を使っている時点で “数十年とかの長期的” なんてものは最初から視野に入っていないはずなので全然問題ないです
もちろん CommonMark のような明文化された標準に準拠するなら期待はできるかもしれないけど、拡張なしの標準 CommonMark でお前ら本当に我慢できるんか? という話で
一応補足しておくと、 CommonMark 0.30 (現行の最新) にはテーブル記法なくて HTML 埋め込むことになります
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